Producción y Bienestar Animalhttps://hdl.handle.net/20.500.14077/26872024-03-29T15:49:08Z2024-03-29T15:49:08ZCaracterización del microbioma del ciego en cuyes (Cavia porcellus) de las razas Inti, Perú y Andina, Chachapoyas-2021Frias Torres Hugohttps://hdl.handle.net/20.500.14077/30702023-02-09T05:35:33Z2023-01-01T00:00:00ZCaracterización del microbioma del ciego en cuyes (Cavia porcellus) de las razas Inti, Perú y Andina, Chachapoyas-2021
Frias Torres Hugo
El cuy (Cavia porcellus) es un roedor de alta importancia económica y nutricional con creciente demanda y poca oferta en el mercado nacional. Existiendo una escasa aplicación de biotecnologías que incrementen eficiencia de producción y mejoramiento en la calidad cárnica. La fisiología digestiva de fermentación bacteriana post-gástrica que ocurre dentro del ciego, donde existe un consorcio bacteriano (el microbioma) especializado en la degradación de fibra, asociado a la absorción de nutrientes. El microbioma tiene un papel importante propia de cada raza asociado a su fenotipo, en ese contexto. El objetivo de este estudio fue caracterizar el microbioma de ciego de cuyes de las razas Inti, Perú y Andina mediante metagenómica para identificar posibles microorganismos asociados a la degradación y absorción de nutrientes. Fueron diseñados dos tratamientos de acuerdo a la raza y el suministro de alimento previo al sacrificio (animales con ayuno de 24 horas y sin ayuno). Así mismo se realizó el secuenciamiento de las regiones hipervariables V3-V4 del gen 16S ARNr al cual se aplicó un análisis bioinformático mediante el paquete QIIME2-2022.2. Encontrando más de 180 secuencias por muestra, de las cuales el 58.37% pertenecían al Phylum Firmicutes y el 27.99% al Phylum Bacteroidetes. No se encontraron diferencias en la composición bacteriana entre las 3 razas estudiadas, sin embargo, se vio que el ayuno por 24 horas tiene un efecto en la diversidad microbiana. En consecuencia, el ciego de cuy está dominado por bacterias pertenecientes a los Phylum (Firmicutes y Bacteroidetes), y a nivel de género (Ruminococcus, Prevotella y Fibrobacter) y especies (Ruminococcus flavefaciens, Ruminococcus albus, Ruminococcus bromii, Prevotella ruminicola y Fibrobacter succinogenes), dichas bacterias implicadas en la degradación de la fibra, candidatos potenciales para usó como probióticos en la producción sostenible del cuy.
2023-01-01T00:00:00ZCaracterización del microbioma uterino y tasa de implantación embrionaria en bovinosMurga Valderrama, Nilton Luishttps://hdl.handle.net/20.500.14077/30252023-02-09T05:35:33Z2023-01-01T00:00:00ZCaracterización del microbioma uterino y tasa de implantación embrionaria en bovinos
Murga Valderrama, Nilton Luis
El útero es una estructura que por mucho tiempo se ha pensado que era libre de microorganismos esto debido a los pocos estudios que existían de este órgano. Actualmente se han desarrollado metodologías para la obtención de la mucosa uterina y secuenciamiento genómico que permitan conocer la población de microbiota existente y su relación con la fertilidad (preñez, aborto, infecciones y enfermedades). En este estudio se evaluó la caracterización del microbioma uterino y su relación con la tasa de implantación embrionaria en bovinos. Se seleccionó mediante evaluación ginecológica, corporal y sanitaria a 53 bovinos posibles receptoras de embrión, a los que 20 días antes de iniciar el protocolo de sincronización se les realizó un raspado uterino en dos segmentos específicos (cuerpo uterino y mitad craneal del cuerno uterino), posteriormente se extrajo ADN genómico de las muestras obtenidas y se realizó la amplificación por PCR convencional del gen 16S. Iniciado el protocolo de sincronización de celo se transfirió los embriones solo a las bovinos con cuerpo lúteo >16mm para realizar el diagnóstico de gestación a los 28 a 30 días. Se logró obtener ADN de buena calidad y pureza de 24 animales donde el mayor porcentaje pertenece a bovinos con mayor número de partos, al evaluar la composición de microbiota se evidenció diferencias entre individuos y agrupamientos realizados (razas, segmento, número de partos e individuo), encontrando dominancia del phylum Proteobacteria y Bacteroidetes. En conclusión, existe relación entre la presencia de los géneros Chryseobacterium, Pedobacter, Pseudomonas y Sphingobacterium en el cuerpo uterino; y Chryseobacterium, Pedobacter, Psychrobacter y Paeniglutamicibacter en mitad craneal del cuerno uterino con el éxito de preñez en bovinos sincronizadas.
2023-01-01T00:00:00ZPrevalencia, caracterización molecular de la fascioliasis e impacto sobre la productividad de bovinos en AmazonasDiaz Quevedo, Clavelhttps://hdl.handle.net/20.500.14077/29722023-03-01T16:54:24Z2022-01-01T00:00:00ZPrevalencia, caracterización molecular de la fascioliasis e impacto sobre la productividad de bovinos en Amazonas
Diaz Quevedo, Clavel
Los objetivos de esta tesis doctoral fueron: i.- determinar la prevalencia de fascioliasis,
ii.- caracterizar genéticamente al agente etiológico de la Fascioliasis y iii.- calcular las
pérdidas económicas causadas por fascioliasis. La prevalencia total de fascioliasis bovina
mediante microscopía de muestras de heces de bovino reportada en las cuatro cuencas
ganaderas fue del 52% (1464), y la prevalencia reportada en muestras de hígado de bovino
provenientes del matadero municipal de Chachapoyas fue del 90,13% (790). La
caracterización molecular de Fasciola spp. se realizó en 110 muestras de ADN extraídas
de duela y en 8 muestras de heces de ganado bovino procedentes de la cuenca ganadera
de Omia, utilizando marcadores específicos ITS1, ITS2, nad1 y cox1. De acuerdo a los
resultados, se obtuvo un 100 % de similitud para Fasciola hepatica, y el estudio con los
marcadores mitocondriales mostró la presencia de 33 haplotipos, de los cuales 25 han
sido reportados por primera vez en este estudio. Los estudios de pérdidas ocasionadas por
la fascioliasis mediante decomiso de hígado mostraron una pérdida productiva de
53,281.00kg de hígado y 6,800kg de carne, lo que ocasiona una pérdida económica en
soles de S/. 104,122.24 y S/. 136,000 respectivamente. Estos resultados muestran que la
fascioliasis tiene una alta prevalencia, así mismo los reportes de nuevos haplotipos, y el
impacto en la producción, indican la necesidad de controlar, vigilar e implementar
propuestas de control para esta parasitosis.
2022-01-01T00:00:00ZLa radiación solar en el desarrollo somático, calidad seminal y fertilidad de Cavia porcellus L.Quispe Ccasa, Hurley Abelhttps://hdl.handle.net/20.500.14077/29142023-02-09T05:35:34Z2022-01-01T00:00:00ZLa radiación solar en el desarrollo somático, calidad seminal y fertilidad de Cavia porcellus L.
Quispe Ccasa, Hurley Abel
La radiación solar genera el ciclo día-noche mediante la luz visible, generando un efecto
llamado fotoperiodo. La comprensión de esta interacción ambiente-animal puede
contribuir a plantear sistemas productivos más sustentables. Esta investigación se propuso
evaluar el efecto de la exposición lumínica sobre el desarrollo somático, calidad seminal
y fertilidad de cobayos. Instalamos tres compartimientos independientes para proveer: un
fotoperiodo artificial con luz LED 10L/14D (EL1), un fotoperiodo con luz solar 10L/14D
(EL2) y uno sin exposición lumínica directa (EL0). Treinta cobayos fueron
aleatoriamente sometidos a los tratamientos de exposición hasta los 107 ± 9,8 días de
edad. Evaluamos pesos semanales, perímetro torácico, consumo de alimento, temperatura
y humedad ambiental, peso de órganos, parámetros de la carne, calidad espermática y
fertilidad. Encontramos efecto de EL en la circunferencia torácica de hembras, siendo
mayor en EL1 que EL0 y EL2 (p<0,05). Aunque hubo mayor proporción de hígado,
corazón y testículos y menores indicadores de color en la carne en machos EL2 que en
EL0 y EL1 (p<0,05; p<0,01), este grupo tuvo los más bajos valores de espermiograma y
no hubo preñeces. Los valores de espermiograma fueron más altos en EL0 y EL1, pero
los empadres fértiles y nacimientos se adelantaron hasta 23 días en EL1 respecto a EL0
(p<0,01). De estos hallazgos se desprenden propuestas para la implementación de las
instalaciones, manejo reproductivo, alimentación y sanidad, que en suma contribuirán a
mejorar la retribución económica de la crianza, calidad de vida del criador y optimizar el
uso de recursos locales y residuos.
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