Caracterización filogenética de la pitahaya amarilla (Selenicereus megalanthus) y sus parientes silvestres en la región Amazonas

Abstract

Selenicereus megalanthus es una especie frutícola de alto valor comercial en la agroindustria tropical, sim embargo, la información genómica disponible para accesiones procedentes de la región Amazonas, Perú, aun es limitada. En este estudio se secuenció y analizó plastomas completos de 30 accesiones de pitahaya colectadas en diferentes localidades de la región. La optimización del protocolo de extracción de ácidos nucleicos mediante CTAB 4X + PVP 4%, permitió obtener ADN de alta calidad (A260/280=1.8-2.0) y alto peso molecular, superando limitaciones por la presencia de polifenoles, polisacáridos y mucílagos en el grupo de las cactáceas. Los plastomas mostraron arquitectura cuadripartita conservada (122,333-133,825 pb, 131-133 genes, 62.8% AT) con 52 microsatélites y regiones hipervariables (trnH-psbA, trnL-trnF). Se desarrollaron 13 primers cpSSR universales con 100% de amplificación exitosa. La reconstrucción filogenética mostró una posición divergente de las accesiones 09 y 10, posicionadas en el clado de Selenicereus (distancias genéticas 0.461-0.456 vs. 0.013-0.016 del grupo principal), sugiriendo captura plastidial antigua sin correlación geográfica (Mantel r=-0.095, p=0.870). El análisis de agrupamientos genético permitió diferenciar dos clusters principales (K=2): 28 accesiones homogéneas (Q=0.92-0.98) y 2 accesiones divergentes (Q=0.88-0.96). Las accesiones 09 y 10 constituyen recursos fitogenéticos de interés por su diferenciación plastidial, por lo que se recomienda ampliar su estudio mediante marcadores nucleares, mayor muestreo geográfico y análisis comparativos con especies relacionadas.